Améliorer l’étude des différences fondées sur le sexe dans les traits complexes et les maladies
Les différences sexuelles phénotypiques sont courantes dans de nombreux aspects de la santé et de la maladie. Malgré le succès des études d’association à l’échelle du génome pour améliorer la compréhension de la façon dont la variation génétique contribue à la manifestation de traits ou de maladies complexes, ces données ont été peu utilisées pour étudier les différences entre les sexes dans les mécanismes sous-jacents.
En réponse, les enquêteurs dirigés par Barbara Stranger, Ph.D., professeur agrégé de pharmacologie, ont élaboré un guide décrivant les meilleures pratiques pour étudier et tester les effets génétiques dépendant du sexe, avec leurs recommandations récemment publiées dans la revue Cellule.
“La chose la plus simple que nous puissions faire pour considérer le sexe comme une influence potentielle sur tout type de trait, de maladie ou de relation est de ventiler nos données par participants masculins et féminins à l’étude. Le problème de ne pas faire ce genre d’analyse signifie que vous manquez l’occasion pour une réponse plus personnalisée selon le sexe à toute question que vous pourriez avoir », a déclaré Stranger, qui est également membre du Center for Genetic Medicine et du Robert H. Lurie Comprehensive Cancer Center de la Northwestern University.
Parmi les meilleures pratiques, Stranger et ses collègues recommandent d’effectuer un contrôle de qualité spécialisé des données génétiques et d’utiliser des modèles statistiques personnalisés pour l’analyse des données.
Par exemple, lorsqu’ils examinent la contribution des variants génétiques sur le chromosome X à des traits complexes, les chercheurs doivent appliquer un contrôle de qualité spécifique et des modèles statistiques pour tenir compte des caractéristiques uniques et de l’héritage du chromosome X.
Les auteurs soulignent également l’importance de tester les modèles génétiques et les mécanismes contribuant aux différences entre les sexes grâce à l’application de différentes approches, telles que l’héritabilité, la corrélation génétique et les analyses de score de risque polygénique.
Enfin, ils décrivent les défis actuels de l’étude des effets génétiques différenciés selon le sexe, y compris les biais dans la participation à l’étude, et décrivent les orientations futures du domaine, notamment l’utilisation d’une terminologie correcte dans la recherche et les rapports dans ce domaine – le « sexe » n’est pas équivalent au « genre » – et en utilisant des définitions précises telles que “sexe assigné à la naissance” ou “sexe défini par des compléments XX ou XY”.
Ils soulignent également l’importance d’une recherche plus inclusive en élargissant les études pour inclure les personnes atteintes d’aneuploïdies des chromosomes sexuels (l’apparition d’un ou plusieurs chromosomes supplémentaires ou manquants) et les différences dans le développement sexuel, ainsi que les personnes intersexuées et transgenres.
“Cela signifie planifier des cohortes qui tiennent compte de la variation quantitative des traits plutôt que de se concentrer uniquement sur les traits sexuels binaires et de développer de nouvelles méthodes et approches statistiques pour intégrer plus pleinement la diversité biologique du sexe”, ont écrit les auteurs.
Alors que l’appréciation du sexe en tant que variable biologique augmente et que des méthodes d’analyse génétique plus spécifiques au sexe sont développées, Stranger a déclaré que l’étude de la base génétique des différences sexuelles phénotypiques peut améliorer la compréhension globale du risque de maladie et de la biologie chez l’un ou l’autre sexe, ainsi que promouvoir médecine de précision et soins équitables.
“Nous ne saurons pas si nous ne regardons pas… et cela a vraiment le potentiel de découvrir de nouvelles connaissances et d’aider à contribuer à une approche plus personnalisée de nombreux aspects de la médecine”, a déclaré Stanger.
