Ce qu’il faut savoir sur la variante bêta du coronavirus
- La variante bêta du coronavirus détectée pour la première fois en Afrique du Sud a peut-être provoqué une maladie plus grave au cours de la deuxième vague du pays, mais d’autres facteurs étaient probablement impliqués.
- Les chercheurs ont examiné les données d’admission des patients COVID-19 de plus de 644 hôpitaux sud-africains de mars 2020 à mars 2021, ainsi que le nombre de cas de coronavirus pendant cette période.
- Les chercheurs ont découvert que les cas de COVID-19, les hospitalisations et les décès à l’hôpital étaient tous plus élevés au cours de la deuxième vague lorsque la variante bêta était plus courante que la première vague lorsque la variante alpha était plus courante.
Au cours de la deuxième vague de pandémie en Afrique du Sud, les cas de COVID-19, les hospitalisations et les décès à l’hôpital ont tous augmenté par rapport à la première vague, a montré une nouvelle étude.
Cela est arrivé à un moment où la variante bêta du coronavirus était prédominante dans le pays, ce qui suggère « que la nouvelle lignée (bêta) en Afrique du Sud pourrait être associée à une mortalité hospitalière accrue au cours de la deuxième vague », ont écrit les auteurs le 9 juillet. dans Lancet Global Health.
Cependant, ils ont noté des limites à l’étude. En outre, d’autres facteurs ont probablement contribué au taux de mortalité plus élevé chez les patients hospitalisés COVID-19 au cours de la deuxième vague du pays.
L’Afrique du Sud a frappé plus fort lors de la deuxième vague
Des recherches antérieures ont révélé que la variante alpha (B.1.1.7) était associée à des hospitalisations et des décès plus élevés au Royaume-Uni. Mais on ne sait pas si la variante bêta provoque une maladie plus grave.
Pour la nouvelle étude, les chercheurs ont examiné les données d’admission des patients COVID-19 de plus de 644 hôpitaux sud-africains de mars 2020 à mars 2021, ainsi que le nombre de cas de coronavirus pendant cette période.
La première vague en Afrique du Sud a culminé en juillet 2020, la deuxième en janvier 2021. Une troisième vague a commencé ce mois-ci.
La variante bêta, également connue sous le nom de B.1.351, a été détectée pour la première fois en Afrique du Sud en septembre 2020. Lors de la deuxième vague, cette variante était la souche prédominante dans le pays.
Les chercheurs ont découvert que les cas de COVID-19, les hospitalisations et les décès à l’hôpital étaient tous plus élevés au cours de la deuxième vague que lors de la première.
De nombreux facteurs peuvent affecter le risque de mourir de COVID-19 à l’hôpital, y compris un nombre élevé d’admissions à l’hôpital, ce qui peut entraîner une surcharge du système hospitalier.
Mais lorsque les chercheurs ont pris en compte les admissions hebdomadaires à l’hôpital, les patients atteints de COVID-19 avaient encore 31 % de chances de plus de mourir pendant la deuxième vague que la première
Cela suggère que la variante bêta peut provoquer une maladie plus grave.
Cependant, les chercheurs notent qu’ils n’avaient pas de données sur la souche des patients, il n’est donc pas possible de lier directement les pires résultats des patients à la variante bêta.
En outre, d’autres facteurs ont contribué à la mortalité plus élevée au cours de la deuxième vague, comme la flambée des admissions à l’hôpital.
“L’augmentation observée de la mortalité des patients admis à l’hôpital aux pics des première et deuxième vagues reflète en partie une pression croissante sur le système de santé”, ont écrit les auteurs.
Au cours de la deuxième vague, les semaines avec des admissions « très élevées » ont été associées à une augmentation de 24 % de la mortalité, par rapport aux semaines avec des admissions faibles.
“Même la perception d’un système de santé tendu peut entraîner une surmortalité due au COVID-19 et à d’autres conditions”, ont ajouté les auteurs, “car les individus pourraient éviter de demander des soins jusqu’à ce que leur état clinique se soit détérioré ou puissent mourir à la maison”.
Dans un éditorial d’accompagnement, Linda-Gail Bekker, PhD, et le Dr Ntobeko AB Ntusi, tous deux de l’Université du Cap en Afrique du Sud, ont réitéré l’importance de maintenir la capacité hospitalière pendant les poussées de COVID-19.
“Une mesure de santé publique cruciale consiste à trouver des moyens d’atténuer le surpeuplement par une expansion rapide des installations hospitalières ou par une stratégie dite d’aplatissement de la courbe”, ont-ils écrit.
Un autre moyen clé de prévenir les décès est de garantir que tous les pays ont un accès égal aux vaccins COVID-19.
« L’Afrique du Sud, et l’Afrique dans son ensemble, n’a pas encore eu la même couverture vaccinale que la plupart du reste du monde », ont écrit Bekker et Ntusi. “Cela est largement dû à l’approvisionnement en vaccins, à la disponibilité mondiale des vaccins et au nationalisme des vaccins.”
La variante bêta se répandra-t-elle largement aux États-Unis ?
La variante bêta représente moins de 1% des cas de coronavirus aux États-Unis, selon les données des Centers for Disease Control and Prevention.
Certains cas supplémentaires de bêta continuent d’apparaître à travers le pays.
Mais étant donné la propagation rapide de la variante delta (B.1.617.2) – qui représentait 57,6% des cas au cours des deux semaines se terminant le 3 juillet – il est peu probable que la variante bêta se propage largement aux États-Unis.
La haute transmissibilité de Delta se joue également en Afrique du Sud. Alors que le pays lutte contre sa troisième vague de pandémie, la variante delta est dominante, rapporte Reuters.
A la recherche de nouvelles variantes
Les scientifiques continueront de surveiller la propagation de la bêta et d’autres variantes en analysant l’information génétique, ou génome, des échantillons de virus – ce que l’on appelle le séquençage génomique.
Le Dr Nahed Ismail, professeur de pathologie et directeur du laboratoire de microbiologie clinique de l’Université de l’Illinois à Chicago, affirme que le séquençage génomique est important pour plusieurs raisons.
La première consiste à savoir quelles souches circulent dans la communauté.
« Nous devons empêcher la transmission de ces [coronavirus] souches qui se propagent plus agressivement que la souche de type sauvage, la souche initiale », a déclaré Ismail. « La seule façon de déterminer celles qui se propagent le plus rapidement est de procéder au séquençage. »
Le séquençage génomique peut également avoir un impact sur les soins que reçoivent les patients COVID-19. Certaines variantes sont résistantes aux anticorps monoclonaux qui ont reçu l’approbation d’urgence de la Food and Drug Administration (FDA).
« Le médecin doit savoir quel type de souches variantes existent [in the patient’s sample] afin de sélectionner l’anticorps monoclonal approprié », a déclaré Ismail.
Les scientifiques surveillent également quelles variantes provoquent des infections révolutionnaires – celles qui surviennent chez des personnes entièrement vaccinées contre COVID-19.
Si une certaine variante provoque un nombre élevé d’infections graves, cela peut indiquer que le vaccin actuel n’est plus très efficace contre cette souche.
La plupart des infections percées ne sont pas graves. De nombreuses personnes entièrement vaccinées ne présentent que des symptômes bénins si elles contractent le virus. Les scientifiques sont principalement préoccupés par les infections révolutionnaires qui entraînent l’hospitalisation de personnes atteintes de COVID-19 sévère.
Au début de la pandémie, les scientifiques ont principalement recherché des mutations dans la partie du génome qui contient des instructions pour la région de pointe du coronavirus. Le virus utilise la protéine de pointe pour pénétrer dans les cellules humaines.
Mais des mutations peuvent survenir dans n’importe quelle partie de l’information génétique du virus, de sorte que les scientifiques se sont depuis concentrés sur l’ensemble du génome.
“Ce virus est extrêmement adaptable et continue de muter”, a déclaré Ismail. “Donc, si vous voulez détecter toutes les variantes, vous ne pouvez pas séquencer une seule région, vous devez séquencer tout le virus.”
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