Les chercheurs développent un outil d’apprentissage automatique pour détecter le cancer plus tôt via une biopsie liquide

Les chercheurs développent un outil d’apprentissage automatique pour détecter le cancer plus tôt via une biopsie liquide

Accueil » Psychologie » Troubles mentaux » Enfant » Les chercheurs développent un outil d’apprentissage automatique pour détecter le cancer plus tôt via une biopsie liquide

Des chercheurs de City of Hope et du Translational Genomics Research Institute (TGen) ont développé et testé une approche innovante d’apprentissage automatique qui pourrait un jour permettre la détection plus précoce du cancer chez les patients en utilisant des prises de sang plus petites. L’étude est publiée dans la revue Médecine translationnelle scientifique.

“De nombreuses preuves montrent que le cancer détecté à un stade ultérieur tue. Cette nouvelle technologie nous rapproche d’un monde où les gens subiront un test sanguin chaque année pour détecter le cancer plus tôt, lorsqu’il sera plus traitable et éventuellement guérissable”, a déclaré Cristian Tomasetti. , Ph.D., auteur correspondant de la nouvelle étude et directeur du Centre de prévention et de détection précoce du cancer de City of Hope.

Tomasetti a expliqué que 99 % des personnes diagnostiquées avec un cancer du sein de stade 1 seront en vie cinq ans plus tard ; cependant, si elle est détectée au stade 4, lorsque la maladie s’est propagée à d’autres organes, la survie à cinq ans tombe à 31 %.

La technologie développée par City of Hope, TGen et ses collègues a pu identifier la moitié des cancers dans les 11 types étudiés. Le test s’est avéré très précis avec un faux positif dans seulement un test sur 100. Il est important de noter que la plupart des échantillons de cancer provenaient de personnes atteintes d’une maladie à un stade précoce, qui présentaient peu ou pas de lésions métastatiques au moment du diagnostic.

En arrière-plan, ils ont développé un algorithme appelé Alu Profile Learning Using Sequencing (A-Plus). Elle a été appliquée à 7 657 échantillons provenant de 5 980 personnes, dont 2 651 souffraient d’un cancer du sein, du côlon et du rectum, de l’œsophage, du poumon, du foie, du pancréas, des ovaires ou de l’estomac.

Lorsqu’une cellule meurt, elle se décompose et une partie de l’ADN de la cellule s’infiltre dans la circulation sanguine. Des signaux de cancer peuvent être trouvés dans cet ADN acellulaire (cfDNA). Le cfDNA des cellules normales se décompose à une taille typique, mais les fragments de cfDNA cancéreux se décomposent à des endroits modifiés. On suppose que cette altération est plus présente dans les régions répétitives du génome.

Ainsi, au lieu d’analyser des mutations spécifiques de l’ADN en recherchant une lettre mal arrangée parmi des milliards de lettres, les chercheurs dirigés par City of Hope et leurs collègues de l’Université John Hopkins ont mis au point une nouvelle façon de détecter la différence dans les schémas de fragmentation dans les régions répétitives du cancer et ADNcf normal. En conséquence, la fragmentomique nécessite environ huit fois moins de sang que le séquençage du génome entier, a déclaré Tomasetti.

“Notre technique est plus pratique pour les applications cliniques car elle nécessite de plus petites quantités de matériel génomique provenant d’un échantillon de sang”, a déclaré Kamel Lahouel, Ph.D., professeur adjoint à la division de génomique intégrée du cancer de TGen et co-premier auteur de l’étude. “Le succès continu dans ce domaine et la validation clinique ouvrent la porte à l’introduction de tests de routine pour détecter le cancer à ses premiers stades.”

Tomasetti est sur le point d’ouvrir un essai clinique à l’été 2024 pour comparer cette approche de test sanguin fragmentomique aux soins standard chez les adultes âgés de 65 à 75 ans. L’essai prospectif déterminera l’efficacité du panel de biomarqueurs dans la détection d’un stade précoce du cancer lorsqu’il est plus traitable.

Le Centre de prévention et de détection précoce du cancer de City of Hope se concentre sur la production de résultats de recherche et de technologies clés basés sur des tests sanguins et des images non invasives pour détecter les cancers des années avant les méthodes de diagnostic conventionnelles.

★★★★★

A lire également