LOVEphage : des scientifiques identifient un nouveau virus intestinal
- Les scientifiques ont largement étudié l’identité et les rôles des bactéries intestinales humaines.
- Cependant, la recherche sur les virus intestinaux humains est à la traîne.
- Dans une nouvelle étude, les scientifiques identifient un nouveau virus qui pourrait avoir une influence importante sur la santé et la maladie humaines.
Le microbiote intestinal humain, y compris les bactéries, les champignons et les virus, est un acteur majeur de la santé humaine.
Les scientifiques ont étudié de manière approfondie les effets des déséquilibres dans les bactéries intestinales. Plusieurs affections, dont l’obésité, le diabète, le cancer, les maladies inflammatoires de l’intestin et les maladies neurologiques, sont toutes associées à un déséquilibre entre ces bactéries.
Bien que les chercheurs travaillent encore sur les détails, il ne fait aucun doute que ces micro-organismes ont un lien complexe avec la santé et la maladie.
Virobiote intestinal
Les experts en santé en savent beaucoup moins sur les virus, appelés virobiota intestinal, qui existent dans l’intestin humain. Une étude récente publiée dans mSystems a étudié et identifié de nombreux génomes viraux présents chez l’homme dans le monde entier.
La plupart des virus résidant dans l’intestin humain sont appelés bactériophages ou phages. Ces virus nécessitent un hôte bactérien pour se reproduire.
Les scientifiques ont lié cette association étroite entre les bactéries et les virus à de nombreuses maladies, telles que les maladies du foie et certaines formes de cancer.
« Il est donc important de faire plus de lumière sur le virobiote et ses génomes collectifs appelés virome, car cela ouvrira la voie à la découverte des interactions complexes au sein du microbiote intestinal et de leurs effets sur l’hôte humain », déclarent les auteurs. de cette étude.
L’étude du virome intestinal n’est pas une mince affaire. Les phages semblent être assez divers et quelque peu uniques chez chaque individu, selon le chercheur principal de l’étude, Jelle Matthijnssens, Ph.D., professeur au Laboratoire de métagénomique virale à la KU Leuven en Belgique.
L’individualité des viromes intestinaux semble être influencée par l’origine géographique, l’âge, le régime alimentaire et l’état de santé.
De plus, le virome intestinal est un domaine d’étude relativement nouveau. Parce que cette recherche en est à ses balbutiements, les scientifiques n’ont pas encore identifié et classé la majorité de ces phages.
Le catalogue danois du virome entérique
Les chercheurs ont analysé 254 échantillons fécaux de 204 participants danois, comprenant des enfants et des adolescents âgés de 6 à 18 ans et des adultes âgés de 40 à 73 ans. L’équipe d’étude a utilisé le protocole Novel Enrichment Technique of Viromes pour purifier les échantillons de selles et séquencer leurs génomes.
À partir de ces données, les chercheurs ont développé le catalogue danois des viromes entériques, ou DEVoC. Selon les auteurs, DEVoC est “le plus grand catalogue de viromes intestinaux humains généré à partir d’échantillons fécaux traités de manière cohérente”.
À l’aide de DEVoC, ils ont comparé 91 viromes intestinaux sains de la population étudiée.
Alors que la plupart des génomes de phages étaient uniques aux individus, 39 étaient présents chez plus de 10 participants en bonne santé. Trois des 39 génomes les plus courants semblaient être associés à l’âge.
L’équipe a ensuite recoupé les résultats de l’étude avec les données mondiales du virome. Deux des 39 génomes phagiques – le phage crAss-like et LoVEphage – ont montré une prévalence remarquablement élevée dans le monde, à 20,6 % et 14,4 %, respectivement.
Les chercheurs ont identifié l’un comme un phage de type crAss appartenant à la sous-famille AlphacrAssvirinae, qui comprend également les virus de l’herpès simplex 1 et 2. L’autre était un phage non décrit auparavant, qu’ils ont surnommé LoVEphage car il code « beaucoup d’éléments viraux ».
« Notre découverte de la large distribution de ce nouveau phage soulève des questions intéressantes en ce qui concerne [phages’] rôle dans le microbiote intestinal humain et implications potentielles sur la santé et les maladies humaines », a déclaré le professeur Matthijnssens dans une interview avec Medical News Today. Il a continué:
“La grande majorité des gènes codés par ces nouveaux phages ont des fonctions inconnues, ce qui rend difficile de prédire comment ils pourraient influencer leur hôte bactérien et l’hôte humain.”
L’avenir de la recherche sur les viromes
MNT s’est également entretenu avec Anthony William Maresso, Ph.D., professeur au Baylor College of Medicine à Houston, TX, au sujet de l’étude. Il a dit:
« L’un des points forts de cette étude est l’examen des signatures virales de nombreux sujets différents. Il montre à quel point le virome est quelque peu individualisé, un peu comme ce qui a été trouvé pour le projet de microbiome humain. Il semble également y avoir une association avec l’âge, et un nouveau phage non décrit en grande abondance a été décrit.
« Dans ce domaine », a poursuivi le professeur Maresso, « qui ne fait qu’effleurer la surface, nous apprenons à quel point le virome phagique total est infiniment complexe et diversifié. La prochaine frontière dans ce domaine sera le développement de moyens d’exploiter le pouvoir fonctionnel de cette génosphère cryptique pour améliorer notre compréhension de la médecine moléculaire, de la biologie cellulaire, de l’écologie prédateur-proie et de l’enzymologie des protéines.
S’exprimant sur les recherches futures, le professeur Matthijnssens a expliqué qu'”il serait très intéressant de rechercher davantage dans des échantillons de selles humaines la présence de ce phage ainsi que de leurs parents génétiques, et de caractériser davantage leurs interactions avec leur hôte bactérien”.
L’étude du virome en est encore à ses balbutiements, mais des découvertes fascinantes existeront certainement juste au-delà de l’horizon.
