Qu’est-ce qui a fait du SARM un « superbactérie » ? Les porcs de ferme peuvent fournir la réponse

La propagation du SARM des porcs aux humains peut aider à expliquer sa résilience. Crédit image : Melissa Milis Photography/Stocksy.

• Une nouvelle étude examine l’histoire de la bactérie résistante aux antibiotiques la plus répandue dans le bétail européen.
• Les chercheurs ont découvert que la bactérie, une forme de SARM, était très stable sur une longue période, augmentant régulièrement sa résistance.
• L’agent pathogène se propage principalement aux humains par contact direct avec les porcs, mais il peut également se propager d’homme à homme.

La pression évolutive créée par l’utilisation généralisée des antibiotiques a conduit à l’émergence d’un nombre croissant de bactéries résistantes aux antibiotiques. L’un des plus difficiles à traiter est le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline, ou SARM, qui résiste à plusieurs antibiotiques autrement efficaces.

Une nouvelle étude du Département de médecine vétérinaire de l’Université de Cambridge au Royaume-Uni étudie une souche de SARM, le complexe clonal 398 (CC398) chez les porcs pour favoriser une meilleure compréhension de la façon dont les bactéries développent leur résistance aux antibiotiques.

CC398 est la souche de SARM la plus courante trouvée dans le bétail européen et une préoccupation croissante pour les humains.

L’auteur principal de l’étude, le Dr Gemma Murray, a déclaré à Medical News Today : « Le SARM CC398 associé au bétail a augmenté en prévalence dans les populations de bétail européennes au cours des deux dernières décennies. Cette augmentation est particulièrement évidente dans les élevages porcins danois, mais a également été observée dans d’autres pays européens et d’autres espèces de bétail.

“On pense que les infections à SARM associées au bétail chez l’homme sont le résultat d’un déversement répété de cette bactérie des populations animales aux humains.”

– Dre Gemma Murray

“Il est important de noter”, a déclaré la chercheuse principale, la Dre Lucy Weinert, au MNT, “que l’infection par le SARM et le SASM (Staphylococcus aureus sensible à la méthicilline) est assez courante chez les personnes, où elle vit leur nez et dans la plupart des cas, les fait-ils pas de mal. Environ 30 % ont le SASM et 1 % ont le SARM. »

L’étude apparaît dans eLife.

Une histoire de résistance

Les chercheurs ont analysé une collection de 1 180 génomes CC398 prélevés sur 27 ans sur du bétail porcin et sur des humains.

Le premier signe de résistance chez la bactérie porcine a été l’acquisition d’un transposon Tn916 – les transposons sont des segments génétiques transposables, également appelés «gènes sauteurs» – fournissant une résistance à la tétracycline qu’elle maintient maintenant depuis 57 ans.

L’étude révèle qu’un gène d’évasion du système immunitaire humain, principalement absent chez le bétail CC398, est apparu et disparu au fil des ans.

Une étude de 2020 a trouvé une souche de CC398 résistante à l’oxacilline, à la gentamicine, à la clarithromycine, à la clindamycine et à la tétracycline.

Stable et adaptable

“Je pense”, a déclaré le Dr Murray, “que l’aspect probablement le plus important de notre étude est qu’elle a révélé que la résistance aux antibiotiques du SARM associé au bétail a persisté de manière stable sur une longue période.”

“C’est inquiétant car cela suggère que la résistance aux antibiotiques dans le SARM associé au bétail n’est pas associée à un coût de remise en forme important”, a-t-elle ajouté.

La plupart des bactéries résistantes sont moins robustes ou en forme que leurs homologues non résistantes en l’absence d’antibiotiques et sont facilement dépassées.

Ce n’est apparemment pas le cas du CC398. “Un faible coût de remise en forme signifiera que les réductions de l’utilisation d’antibiotiques dans le bétail peuvent avoir un impact limité sur le succès de cette souche dans les populations de bétail”, a déclaré le Dr Murray, “c’est-à-dire qu’il peut être difficile de s’en débarrasser.”

Passer du porc à l’homme

“Les personnes qui travaillent directement avec le bétail (par exemple, les travailleurs agricoles) sont plus à risque d’infection par CC398”, a noté le Dr Murray. “Mais le CC398 peut également être transmis d’homme à homme, ce qui peut conduire le CC398 à pénétrer dans des établissements de santé où les personnes sont plus à risque d’infection.”

L’étude note que le SARM associé au bétail chez l’homme est en augmentation.

Le Dr Weinert a expliqué: «C’est en augmentation chez les humains parce que c’est en augmentation chez les porcs, et par conséquent, la transmission du porc à l’homme devient plus courante. Il y a des suggestions que les infections chez l’homme ont culminé au Danemark, où le CC398 a été étudié en profondeur.

“Pour la plupart des gens la plupart du temps”, a déclaré le Dr Murray, “le portage du CC398 ne conduira pas à une infection. De plus, les infections à SARM ont diverses sources — [the bacteria] peut être porté par des personnes en bonne santé. Ainsi, le bétail [is] une seule source possible.

Selon le Dr Weinert, «[o]Dans l’ensemble, le CC398 est rare chez les humains et la plupart de nos cas de SARM proviennent d’autres humains, c’est là que nous devrions diriger nos efforts de contrôle – par exemple, en réduisant notre utilisation d’antibiotiques.

Le Dr Weinert a indiqué que «[p]Les gens peuvent éviter l’infection par n’importe quel SARM en ayant une bonne hygiène des mains et en ne partageant pas d’objets personnels comme des serviettes ou des rasoirs.“

Corraling CC398

Le Dr Murray a déclaré que la “recherche actuelle ne suggère pas directement un moyen de réduire la présence de CC398 chez les porcs”.

Au contraire, a-t-elle expliqué, «[i]Cela suggère que la population CC398 pourrait en fait être assez résiliente. Il est capable de maintenir et d’acquérir une résistance à plusieurs classes d’antibiotiques.

L’étude, a proposé le Dr Murray, “pourrait suggérer que nous devrions enquêter davantage sur la façon dont le CC398 est transmis entre les populations de bétail, et peut-être augmenter la biosécurité pour réduire la transmission entre les populations de bétail”.

Le Dr Weinert a également souligné que « des recherches antérieures ont montré que le mouvement des porcs est associé à sa propagation. Le Danemark a introduit un plan d’action national pour réduire la prévalence du CC398, qui comprend une meilleure hygiène au sein des troupeaux et pendant le transport, et la prévention du mouvement des troupeaux MRSA-négatifs vers les troupeaux MRSA-positifs. Les épidémiologistes étudient l’impact de nouvelles mesures de contrôle.

Le Dr Murray a ajouté : « Il a été suggéré que [a] l’interdiction de l’utilisation d’oxyde de zinc dans l’alimentation animale pourrait entraîner une réduction de la prévalence du SARM associé au bétail, mais nos résultats suggèrent que cela pourrait ne pas avoir beaucoup d’impact sur le CC398.