Détection d’ADN extrachromosomique dans l’œsophage de Barrett liée au développement du cancer
Une étude multi-institutions qui comprenait des chercheurs de l’Université de Stanford, de l’Université de Californie à San Diego, de l’Université de Cambridge, du Fred Hutchinson Cancer Center et d’autres a examiné le développement de l’ADN extrachromosomique chez les patients atteints d’adénocarcinome de l’œsophage ou de l’œsophage de Barrett.
Dans l’article « Extrachromosomal DNA in the cancerous transformation of Barrett’s oesophage », publié dans Nature, les chercheurs identifient des aspects jusque-là inconnus de la présence d’ADN extrachromosomique et leur rôle potentiel dans l’œsophage de Barrett. David H. Wang a publié un article News & Views dans le même journal sur l’étude.
L’œsophage de Barrett est une anomalie tissulaire précancéreuse qui touche environ 1,6 % de la population américaine. La condition est généralement inoffensive, définie par des cellules de la muqueuse de l’œsophage qui deviennent plus intestinales et est fréquemment associée à des brûlures d’estomac et à des régurgitations acides.
Bien que potentiellement cancéreuse, l’identification de la maladie est suivie d’une surveillance fréquente et traitée uniquement s’il y a des modifications progressives substantielles de la muqueuse de l’œsophage. La bonne nouvelle est que la plupart des personnes diagnostiquées avec l’œsophage de Barrett (environ 92 %) ne développent pas d’adénocarcinome de l’œsophage (EAC). Ceci, malheureusement, signifie également qu’environ 8% des patients atteints de l’œsophage de Barrett développeront une EAC.
L’amplification génique mutée sur l’ADN extrachromosomique (ecDNA) a déjà été reconnue comme étant à l’origine de l’évolution des tumeurs et de la résistance au traitement et est associée à de mauvais résultats. On ne sait pas si l’ecDNA est une manifestation ultérieure de l’instabilité génomique des tumeurs ou une occurrence précoce de la transition d’un tissu anormal au cancer, bien que l’on s’attende à ce que ce soit plus tard sur la base d’études observationnelles antérieures.
Pour enquêter, les chercheurs ont analysé les données de séquençage du génome entier de patients atteints d’un adénocarcinome de l’œsophage ou de l’œsophage de Barrett. Ces données comprenaient 206 biopsies dans la surveillance de l’œsophage de Barrett et les cohortes EAC de l’Université de Cambridge.
Les chercheurs ont également analysé les données de séquençage du génome entier et d’histologie à partir de biopsies collectées dans plusieurs régions à deux moments de 80 patients dans une étude cas-témoin au Fred Hutchinson Cancer Center.
Dans les cohortes de Cambridge, la fréquence de l’ecDNA a augmenté entre l’EAC de l’œsophage de Barrett au stade précoce (24 %) et au stade avancé (43 %), ce qui suggère que l’ecDNA se forme au cours de la progression du cancer.
Dans la cohorte du Fred Hutchinson Cancer Center, 33 % des patients qui ont développé une EAC ont eu au moins une biopsie œsophagienne avec ecDNA avant ou lors du diagnostic d’EAC.
Dans les biopsies prélevées avant le diagnostic du cancer, des niveaux plus élevés d’ADNc étaient présents dans les échantillons de patients qui ont développé plus tard un EAC que dans les échantillons de ceux qui n’ont pas développé de cancer. La présence précoce d’ecDNA a exclu le scénario où l’ecDNA se présente comme une manifestation ultérieure liée à la tumeur de l’instabilité du génome.
Les résultats sont extrêmement importants en ce sens qu’ils révèlent que l’ecDNA peut survenir avant le développement d’un cancer diagnostiqué et que des niveaux plus élevés sont associés à la progression. Cela suggère la possibilité d’un marqueur de maladie précancéreuse, permettant des interventions précoces cliniquement éclairées pour les patients atteints de l’œsophage de Barrett en effectuant des tests ecDNA lors de la présentation précoce de la maladie. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour développer des méthodes cliniques de détection et de traitement.
